Conseille sur mes demarche d'arrêt travail

Bonjour mesdames , alors je suis enceinte de 4 mois j'ai trouvé un travail le 2 jusqu'au 30 septembre entant que prestataire et je me suis arrêté 3 j parce que j'avais des douleurs au dos car j'ai un poste vraiment chiant et du coup l’agence qui m'a employés ma conseille de faire un arret de travail pour justifier mes absences comme ça je serais payé et j'ai vue qu'il fallait le faire sous 48 heure aujourd'hui j'ai pris rendez vous chez le médecin a 16 h 30 pour qu'il puisse le faire mais pensez vous que l’assurance maladie vas acceptées de me payer les jours que j'ai arrêté ? C'est vraiment urgent